2月28日，百程旅行网发布内部通知称，因疫情影响，资金不能维系公司继续运转，决定关闭公司并启动清算准备。通知称，百程旅行将于3月10日先行支付1月薪资，3月起将不再缴纳五险一金及发放工资。“请员工给与理解和支持，并提前做好自谋出路的准备。”

天眼查数据显示，目前杭州阿里创业投资有限公司持有该公司832.61万股，持股比例为16.47%，为第二大股东。百程旅行创始人曾松及其妻子马琳通过天津睿恒顺和百程科技分别间接持有30.42%和3.08%的股权，合计持有33.80%的股权，为百程第一大股东。

天眼查数据显示，百程旅行网曾于2008年3月获得富达亚洲、银瑞达千万美元A轮投资;2014年3月曾完成由阿里牵头的近2000万美元B轮融资。2015年7月，百程旅行网号称将完成千和资本领投，点睛资本、飞猪资本、博雅资本等新兴投资机构跟投的2亿元融资。

2016年4月，百程成功挂牌新三板，成为O2O出境旅游第一股。报告显示，自2013年至2018年上半年，百程旅行净利润均为亏损状态，亏损额分别为1761万元、3663万元、3935万元、4511万元、2795万元以及1286万元。

2019年3月，百程旅行网表示基于公司自身规划和战略发展的需要，为提高融资效率，降低成本，经股东提议及审慎考虑，公司拟申请公司股票在全国中小企业股份转让系统终止挂牌。同年7月18日，百程旅行发布公告称在新三板终止挂牌。