住房公积金贷款还款会不会二次扣款需要分为以下几种情况：

1、如果贷款银行在第一次进行扣款时扣款成功了，那么就不会第二次进行扣款了;

2、如果贷款银行在第一次进行扣款时扣款失败了，那么就会第二次进行扣款。如果借款人办理了公积金对冲业务，那么贷款银行会首先从公积金账户中扣除余额，如果公积金账户的余额不足以偿还贷款本息，那么贷款银行会再会从绑定的银行卡中扣除还款本息。

虽然公积金贷款还款是会自动扣款，但借贷人要提前了解账户是否有足够的余额，同时需要注意的是，借贷人在还款日当天一定要确定是否扣款成功，避免出现扣款不成功，造成逾期的情况。

公积金贷款怎么还款?

借款人应按借款合同约定的还款计划和还款方式自贷款发放次月起用代扣或柜台两种途径偿还贷款本息：

1、正常还款：借款人委托贷款银行通过储蓄卡、存折等方式代扣偿还贷款本息。借款人在委托贷款银行通过储蓄卡、存折代扣每月偿还贷款本息的同时，也应委托公积金中心和贷款银行，在其按月偿还贷款本息后，每月提取本人及配偶的住房公积金(含补充住房公积金及按月住房补贴)划入借款人住房公积金卡银行储蓄账户，作为下月偿还贷款本息的代扣资金。

2、提前还款：公积金贷款和组合贷款公积金部分的提前还款应到公积金中心各区县管理部办理。组合贷款按揭部分的提前还款应到贷款银行网点办理。

办理个人住房公积金贷款的职工，贷款当前不存在逾期未还的，可到公积金中心各区县管理部申请直接利用本人及配偶住房公积金账户余额，提前偿还公积金贷款。

办理组合贷款的职工，贷款当前不存在逾期未还的，还可到银行柜台申请申请提取本人及配偶住房公积金账户余额，提前偿还个人住房公积金组合贷款中按揭部分。